روش کلی برای استخراج فاز جامد به شرح زیر است:

1. فعال کردن جاذب: کارتریج استخراج فاز جامد را قبل از استخراج نمونه با یک حلال مناسب بشویید تا جاذب مرطوب بماند، که می تواند ترکیبات هدف یا ترکیبات مزاحم را جذب کند.حالت های مختلف فعال سازی کارتریج استخراج فاز جامد از حلال های مختلف استفاده می کنند:

(1) جاذب های ضعیف قطبی یا غیرقطبی مورد استفاده در استخراج فاز جامد با فاز معکوس معمولاً با یک حلال آلی محلول در آب مانند متانول شسته می شوند و سپس با آب یا محلول بافر شسته می شوند.همچنین می توان قبل از شستشو با متانول با یک حلال قوی (مانند هگزان) شستشو داد تا ناخالصی های جذب شده روی جاذب و تداخل آنها با ترکیب مورد نظر از بین برود.

(2) جاذب قطبی مورد استفاده در استخراج فاز جامد معمولی معمولاً با حلال آلی (ماتریس نمونه) جایی که ترکیب هدف قرار دارد شسته می شود.

(3) جاذب مورد استفاده در استخراج فاز جامد تبادل یونی را می توان با حلال نمونه شست و شو داد که برای نمونه هایی در حلال های آلی غیر قطبی استفاده می شود.هنگامی که برای نمونه در حلال های قطبی استفاده می شود، می توان آن را با حلال های آلی محلول در آب شستشو داد.

به منظور مرطوب نگه داشتن جاذب در کارتریج SPE پس از فعال سازی و قبل از افزودن نمونه، باید حدود 1 میلی لیتر از حلال برای فعال سازی پس از فعال سازی روی جاذب نگهداری شود.

2. بارگذاری نمونه: نمونه جامد مایع یا محلول را در کارتریج استخراج فاز جامد فعال شده بریزید و سپس از خلاء، فشار یا سانتریفیوژ استفاده کنید تا نمونه وارد جاذب شود.

3. شستشو و شستشو: پس از ورود نمونه به جاذب و جذب ترکیب هدف، می توان ترکیب تداخلی ضعیف تری را با حلال ضعیف تری شست و سپس ترکیب مورد نظر را با حلال قوی تری شسته و جمع آوری کرد..شستشو و شستشو همانطور که قبلا توضیح داده شد، ماده شوینده یا شوینده را می توان از طریق جاذب با خلاء، فشار یا سانتریفیوژ عبور داد.

اگر جاذب به گونه‌ای انتخاب شود که جذب ضعیف یا بدون جذب به ترکیب هدف و جذب قوی به ترکیب تداخل‌کننده داشته باشد، ترکیب مورد نظر نیز می‌تواند ابتدا شستشو و جمع‌آوری شود، در حالی که ترکیب تداخل‌کننده حفظ می‌شود (جذب).) روی جاذب، این دو از هم جدا می شوند.در بیشتر موارد، ترکیب مورد نظر روی جاذب باقی می‌ماند و در نهایت با یک حلال قوی شسته می‌شود که برای خالص‌سازی نمونه مفیدتر است.