1. Temeljne raziskave nukleinskih kislin: genomsko kloniranje
2. Asimetrični PCR za pripravo enoverižne DNA za sekvenciranje DNA
3. Določanje neznanih regij DNA z inverzno PCR
4. PCR z reverzno transkripcijo (RT-PCR) se uporablja za odkrivanje stopnje genske ekspresije v celicah, količine RNA virusa in neposrednega kloniranja cDNA specifičnih genov.
5. Fluorescenčni kvantitativni PCR se uporablja za spremljanje produktov PCR v realnem času
6. Hitro pomnoževanje koncev cDNA
7. Odkrivanje izražanja genov
8. Medicinske aplikacije: odkrivanje bakterijskih in virusnih bolezni;diagnoza genetskih bolezni;diagnoza tumorjev;uporabiti za forenzične dokaze