ขั้นตอนทั่วไปสำหรับการสกัดเฟสของแข็งมีดังนี้:

1. การเปิดใช้งานตัวดูดซับ: ล้างคาร์ทริดจ์สกัดแบบโซลิดเฟสด้วยตัวทำละลายที่เหมาะสมก่อนทำการสกัดตัวอย่าง เพื่อให้ตัวดูดซับเปียก ซึ่งสามารถดูดซับสารประกอบเป้าหมายหรือสารประกอบที่รบกวนได้โหมดต่างๆ ของการเปิดใช้งานคาร์ทริดจ์สกัดโซลิดเฟสจะใช้ตัวทำละลายต่างกัน:

(1) ตัวดูดซับที่มีขั้วอ่อนหรือไม่มีขั้วที่ใช้ในการสกัดโซลิดเฟสแบบรีเวิร์สเฟส มักจะถูกล้างด้วยตัวทำละลายอินทรีย์ที่ละลายน้ำได้ เช่น เมทานอล จากนั้นจึงล้างด้วยน้ำหรือสารละลายบัฟเฟอร์นอกจากนี้ยังสามารถล้างด้วยตัวทำละลายที่มีความเข้มข้น (เช่น เฮกเซน) ก่อนล้างด้วยเมทานอลเพื่อกำจัดสิ่งเจือปนที่ดูดซับบนตัวดูดซับและการรบกวนกับสารประกอบเป้าหมาย

(2) ตัวดูดซับที่มีขั้วที่ใช้ในการสกัดโซลิดเฟสปกติจะถูกชะด้วยตัวทำละลายอินทรีย์ (เมทริกซ์ตัวอย่าง) ซึ่งเป็นที่ตั้งของสารประกอบเป้าหมาย

(3) ตัวดูดซับที่ใช้ในการสกัดเฟสของแข็งด้วยการแลกเปลี่ยนไอออนสามารถล้างด้วยตัวทำละลายตัวอย่าง เมื่อใช้กับตัวอย่างในตัวทำละลายอินทรีย์ที่ไม่มีขั้วเมื่อใช้กับตัวอย่างในตัวทำละลายที่มีขั้ว สามารถล้างด้วยตัวทำละลายอินทรีย์ที่ละลายน้ำได้ หลังจากล้างแล้ว ให้ล้างด้วยสารละลายน้ำที่มีค่า pH เหมาะสม และมีตัวทำละลายอินทรีย์และเกลือบางชนิด

เพื่อให้ตัวดูดซับในคาร์ทริดจ์ SPE เปียกหลังจากการเปิดใช้งานและก่อนที่จะเติมตัวอย่าง ควรเก็บตัวทำละลายสำหรับการกระตุ้นประมาณ 1 มิลลิลิตรไว้บนตัวดูดซับหลังการเปิดใช้งาน

2. การโหลดตัวอย่าง: เทตัวอย่างของเหลวหรือของแข็งที่ละลายลงในคาร์ทริดจ์สกัดเฟสของแข็งที่เปิดใช้งาน จากนั้นใช้สุญญากาศ แรงดัน หรือการหมุนเหวี่ยงเพื่อให้ตัวอย่างเข้าสู่ตัวดูดซับ

3. การล้างและการชะล้าง: หลังจากที่ตัวอย่างเข้าสู่ตัวดูดซับและสารประกอบเป้าหมายถูกดูดซับแล้ว สารประกอบรบกวนที่คงอยู่อย่างอ่อนสามารถถูกชะล้างออกไปด้วยตัวทำละลายที่อ่อนกว่า จากนั้นสารประกอบเป้าหมายสามารถถูกชะออกด้วยตัวทำละลายที่แรงกว่าและถูกรวบรวม.การล้างและการชะล้าง ตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ สารชะหรือสารชะสามารถผ่านตัวดูดซับได้โดยวิธีสุญญากาศ แรงดัน หรือการหมุนเหวี่ยง

หากตัวดูดซับถูกเลือกเพื่อให้มีการดูดซับที่อ่อนหรือไม่มีการดูดซับไปที่สารประกอบเป้าหมายและการดูดซับอย่างแรงต่อสารประกอบที่รบกวน สารประกอบเป้าหมายยังสามารถถูกล้างและรวบรวมก่อน ในขณะที่สารประกอบที่รบกวนถูกคงไว้ (การดูดซับ)) บนตัวดูดซับ ทั้งสองถูกแยกออกจากกันในกรณีส่วนใหญ่ สารประกอบเป้าหมายจะคงอยู่บนตัวดูดซับ และสุดท้ายจะถูกชะออกด้วยตัวทำละลายชนิดเข้มข้น ซึ่งเอื้อต่อการทำให้ตัวอย่างบริสุทธิ์มากกว่า