אוליגונוקלאוטיד (Oligonucleotide), מתייחס בדרך כלל למקטע פולינוקלאוטיד ליניארי של 2-10 שיירי נוקלאוטידים המקושרים בקשרי פוספודיסטר, אך כאשר משתמשים במונח זה, מספר שיירי הנוקלאוטידים אין תקנות מחמירות.בספרות רבות, מולקולות פולינוקלאוטידים המכילות 30 שאריות נוקלאוטידים או יותר נקראות גם אוליגונוקלאוטידים.אוליגונוקלאוטידים יכולים להיות מסונתזים אוטומטית על ידי מכשירים.הם יכולים לשמש כפריימרים לסינתזת DNA, בדיקות גנים וכו', ויש להם מגוון רחב של שימושים במחקר ביולוגיה מולקולרית מודרנית.

יישום

אוליגונוקלאוטידים משמשים לעתים קרובות כבדיקות לקביעת מבנה ה-DNA או ה-RNA, והם משמשים בתהליכים כגון שבב גנים, אלקטרופורזה והכלאה של פלואורסצנטי באתרו.

ה-DNA המסונתז על ידי האוליגונוקלאוטיד יכול לשמש בתגובת פילמור השרשרת, שיכולה להגביר ולאשר כמעט את כל שברי ה-DNA.בתהליך זה, האוליגונוקלאוטיד משמש כפריימר לשילוב עם הפרגמנט המשלים המסומן ב-DNA כדי ליצור עותק DNA..

אוליגונוקלאוטידים רגולטוריים משמשים לעיכוב שברי RNA ולמנוע את תרגוםם לחלבונים, שיכולים למלא תפקיד מסוים בעצירת הפעילות של תאים סרטניים.